HDClone będzie próbować optymalnie rozwiązywać błędy sektorowe, jeśli zostaną napotkane. Jeśli nie będzie to możliwe, zostaną one wliczone do odpowiednich statystyk błędów.
W przypadku wystąpienia błędów odczytu, HDClone zastosuje rozmaite strategie w celu odzyskania dotkniętych sektorów. Czas niezbędny dla tej operacji zależy od typu oraz rozmiaru wykorzystanego nośnika. Próby odzyskania mogą trwać kilka sekund lub minut dla każdego sektora. Wskazane jest więc każdorazowe uruchomienie opcji SafeRescue, gdyż operacje na wadliwych sektorach nastąpią jedynie po ukończeniu kopiowania wszystkich poprawnych obszarów. W przypadku gdy proces ten trwa zbyt długo, może on zostać anulowany bez utraty danych na sprawnych obszarach.
Błędy odczytu mogą wystąpić jedynie na nośniku źródłowym podczas procesu kopiowania. HDClone podejmie próby odczytu wadliwych obszarów natychmiast po zakończeniu procesu kopiowania (opcja SafeRescue) w osobnym trybie rozwiązywania problemów. Podczas procesu naprawy błędów, liczba wyświetlonych błędów odczytu może się zmniejszyć wraz z odratowanymi obszarami na źródle.
Błędy zapisu mogą wystąpić jedynie podczas procesu kopiowania i jedynie na nośniku docelowym. HDClone podejmie próbę odczytu błędnych obszarów natychmiast po ukończeniu procesu kopiowania (opcja SafeRescue) przy pomocy specjalnych strategii odzyskiwania danych w osobnym trybie rozwiązywania problemów. Podczas procesu naprawy błędów, liczba wyświetlonych błędów odczytu może się zmniejszyć wraz z odratowanymi obszarami na celu.
Gdy aktywna jest opcja Weryfikacji, HDClone uruchomi proces rozwiązywania problemów po ukończeniu procesu kopiowania. Za błąd weryfikacji uznawane są dwa sektory, których dane na źródle oraz celu nie odpowiadają sobie. Dodatkowo, błędy odczytu występujące podczas weryfikacji na jednym lub obu porównywanych obszarach są również traktowane jako błędy weryfikacji. Liczba błędów weryfikacji obrazuje jak bardzo źródło oraz cel odpowiadają sobie po klonowaniu.