W kopii obszaru częściowego, nie zostanie wykorzystany cały nośnik (napęd/partycja) źródła i/lub celu, a jedynie obszar częściowy.
Dla nośnika źródłowego oraz docelowego możliwy jest wybór dokładnego obszaru sektorowego na stronie Opcje zaawansowane. Wprowadź sektor rozpoczynający obszar a sektor ten interpretowany będzie jako pierwszy sektor zawarty w tym obszarze. Wprowadź liczbę sektorów. Sektor końcowy zostanie automatycznie dostosowany na bazie liczby sektorów poczynając od pierwszego sektora. Sektor końcowy to ostatni zawarty sektor.
Obszar sektorowy zdefiniowany jest jako obszar połączonych sektorów na nośniku magazynowym, który, w przypadku partycji, jest relatywny do ich pozycji początkowych. HDClone będzie kopiował pierwszy sektor źródła do pierwszego sektora obszaru docelowego, powtarzając dla każdego kolejnego. W porównaniu do normalnej kopii, główną różnicą jest klonowanie zdefiniowanego obszaru częściowego zamiast całego napędu lub partycji.